Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX3Q9UBR4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms