Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms