Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKNOX2Q96KN3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKNOX2Q96KN3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms