Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD35Q8N283 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms