Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cacnb2Q8CC27 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacnb2Q8CC27 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms