Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC84Q86UT8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms