Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00575Q6W349 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms