Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q5VSD8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q5VSD8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q5VSD8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Q5VSD8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms