Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NHSL1Q5SYE7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms