Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
BSXQ3C1V8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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