Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NBPF1Q3BBV0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms