Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms