Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DHX9Q08211 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DHX9Q08211 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms