Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TOP2BQ02880 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2BQ02880 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms