Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUCB1Q02818 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms