Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HPCAP84074 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms