Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRGP23470 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRGP23470 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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