Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MS4A1P11836 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms