Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB5P09067 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB5P09067 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB5P09067 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB5P09067 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms