Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg2O55111 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms