Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01387J3KSC0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms