Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpne6Q9Z140 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpne6Q9Z140 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpne6Q9Z140 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms