Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUQ2

Preb, Prolactin regulatory element-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrebQ9WUQ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrebQ9WUQ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrebQ9WUQ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrebQ9WUQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrebQ9WUQ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrebQ9WUQ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms