Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cry2Q9R194 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cry2Q9R194 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cry2Q9R194 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cry2Q9R194 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms