Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gpc1Q9QZF2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gpc1Q9QZF2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gpc1Q9QZF2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gpc1Q9QZF2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms