Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc4Q9QUQ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trpc4Q9QUQ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpc4Q9QUQ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc4Q9QUQ5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
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