Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trpc4apQ9JLV2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trpc4apQ9JLV2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trpc4apQ9JLV2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trpc4apQ9JLV2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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