Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkd2l2Q9JLG4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkd2l2Q9JLG4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pkd2l2Q9JLG4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms