Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Habp4Q9JKS5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Habp4Q9JKS5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Habp4Q9JKS5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Habp4Q9JKS5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Habp4Q9JKS5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Habp4Q9JKS5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms