Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc4Q9ES56 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trappc4Q9ES56 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms