Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ripk4Q9ERK0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ripk4Q9ERK0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ripk4Q9ERK0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ripk4Q9ERK0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ripk4Q9ERK0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ripk4Q9ERK0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms