Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn12Q9ER56 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Capn12Q9ER56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn12Q9ER56 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn12Q9ER56 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn12Q9ER56 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms