Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr6Q9EQ16 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr6Q9EQ16 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cxcr6Q9EQ16 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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