Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ergic1Q9DC16 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ergic1Q9DC16 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ergic1Q9DC16 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms