Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Xrn2Q9DBR1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrn2Q9DBR1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrn2Q9DBR1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrn2Q9DBR1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xrn2Q9DBR1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xrn2Q9DBR1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Xrn2Q9DBR1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrn2Q9DBR1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Xrn2Q9DBR1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms