Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smdt1Q9DB10 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smdt1Q9DB10 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smdt1Q9DB10 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smdt1Q9DB10 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 638.4 ms