Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhobtb1Q9DAK3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb1Q9DAK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb1Q9DAK3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhobtb1Q9DAK3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhobtb1Q9DAK3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rhobtb1Q9DAK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rhobtb1Q9DAK3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhobtb1Q9DAK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms