Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pradc1Q9D9N8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pradc1Q9D9N8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pradc1Q9D9N8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pradc1Q9D9N8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms