Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Slc52a2Q9D8F3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Slc52a2Q9D8F3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Slc52a2Q9D8F3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Slc52a2Q9D8F3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Slc52a2Q9D8F3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms