Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca1Q9D7Z6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca1Q9D7Z6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clca1Q9D7Z6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca1Q9D7Z6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms