Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Capns2Q9D7J7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Capns2Q9D7J7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capns2Q9D7J7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Capns2Q9D7J7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 307.6 ms