Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnfsf13Q9D777 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf13Q9D777 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf13Q9D777 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf13Q9D777 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnfsf13Q9D777 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnfsf13Q9D777 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tnfsf13Q9D777 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfsf13Q9D777 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfsf13Q9D777 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms