Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4R2

Mgat4d, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein MGAT4D, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat4dQ9D4R2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mgat4dQ9D4R2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mgat4dQ9D4R2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mgat4dQ9D4R2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mgat4dQ9D4R2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mgat4dQ9D4R2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mgat4dQ9D4R2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mgat4dQ9D4R2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mgat4dQ9D4R2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mgat4dQ9D4R2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mgat4dQ9D4R2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mgat4dQ9D4R2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms