Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt20Q9D312 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt20Q9D312 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt20Q9D312 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt20Q9D312 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt20Q9D312 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms