Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Susd3Q9D176 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Susd3Q9D176 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Susd3Q9D176 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Susd3Q9D176 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd3Q9D176 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms