Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ss18l2Q9D174 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ss18l2Q9D174 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ss18l2Q9D174 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms