Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyc1Q9D0M3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyc1Q9D0M3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyc1Q9D0M3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyc1Q9D0M3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms