Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mdm1Q9D067 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mdm1Q9D067 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mdm1Q9D067 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms