Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl55Q9CZ83 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl55Q9CZ83 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl55Q9CZ83 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl55Q9CZ83 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl55Q9CZ83 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl55Q9CZ83 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl55Q9CZ83 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl55Q9CZ83 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl55Q9CZ83 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl55Q9CZ83 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl55Q9CZ83 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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