Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Alpk1Q9CXB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Alpk1Q9CXB8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Alpk1Q9CXB8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Alpk1Q9CXB8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Alpk1Q9CXB8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Alpk1Q9CXB8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Alpk1Q9CXB8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Alpk1Q9CXB8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Alpk1Q9CXB8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Alpk1Q9CXB8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms